分子生物學(xué)
環(huán)氧水解酶計(jì)算設(shè)計(jì)合成手性雜環(huán)化合物方面取得進(jìn)展
手性雜環(huán)化合物廣泛應(yīng)用于合成化學(xué)、天然產(chǎn)物、醫(yī)藥、農(nóng)藥與材料等領(lǐng)域,其中手性氮/氧雜環(huán)化合物是許多生物及生理活性分子的核心結(jié)構(gòu)單元。目前關(guān)于手性氮/氧雜環(huán)化合物的合成主要涉及金屬催化與有機(jī)小分子催化,而近年來,通過計(jì)算設(shè)計(jì)與改造的生物催化方法已經(jīng)成為研究的熱點(diǎn)。
中國科學(xué)院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所研究員孫周通團(tuán)隊(duì)等通過對檸檬烯環(huán)氧水解酶(LEH)底物結(jié)合口袋活性位點(diǎn)進(jìn)行計(jì)算設(shè)計(jì),重構(gòu)其活性中心氫鍵網(wǎng)絡(luò),打破原有依賴水分子對環(huán)氧底物的開環(huán)機(jī)制,實(shí)現(xiàn)了其催化環(huán)氧化合物的鮑德溫環(huán)化反應(yīng)與去對稱化反應(yīng),并合成了多種手性氮/氧雜環(huán)化合物,可用于構(gòu)建系列天然產(chǎn)物以及潛在藥物前體。研究通過晶體結(jié)構(gòu)解析和計(jì)算模擬等手段,揭示了最優(yōu)突變體活性中心可以介導(dǎo)底物分子內(nèi)親核環(huán)化并生成手性雜環(huán)化合物的分子機(jī)制。該研究為同類酶促新反應(yīng)設(shè)計(jì),實(shí)現(xiàn)生物合成新分子提供了新的借鑒。
相關(guān)成果發(fā)表在Nature Communications上。相關(guān)研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、天津市自然科學(xué)基金項(xiàng)目和天津市合成生物技術(shù)創(chuàng)新能力提升行動(dòng)的資助。
計(jì)算設(shè)計(jì)環(huán)氧水解酶實(shí)現(xiàn)手性雜環(huán)化合物的合成示意圖

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Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.: 研發(fā)新探針實(shí)現(xiàn)線粒體多色STED成像
線粒體是細(xì)胞的動(dòng)力來源,影響細(xì)胞穩(wěn)態(tài)、增殖、死亡的關(guān)鍵信號通路。由于線粒體的動(dòng)態(tài)行為以及與其他細(xì)胞器的豐富相互作用,熒光顯微鏡的發(fā)展特別推動(dòng)了線粒體研究。線粒體內(nèi)膜(inner membrane,IM)向內(nèi)凹陷形成許多層狀或管狀的內(nèi)嵴,其間距通常小于100nm,導(dǎo)致傳統(tǒng)熒光顯微鏡無法觀察到其內(nèi)部精細(xì)結(jié)構(gòu)。因此,基于固定樣本的電子顯微鏡技術(shù)一直作為捕捉線粒體膜
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Nature:繪制靈長類胚胎原腸運(yùn)動(dòng)至早期器官發(fā)育轉(zhuǎn)錄組圖譜
人的生命始于精子與卵子融合形成受精卵(胚胎期第0天;Embryonic day 0;E0),受精卵經(jīng)歷卵裂形成囊胚,囊胚在E7左右種植到母體子宮進(jìn)一步發(fā)育。E14開始,胚胎經(jīng)歷原腸運(yùn)動(dòng),胚胎后部細(xì)胞發(fā)生大規(guī)模定向遷移,并形成原條細(xì)胞。原條細(xì)胞進(jìn)一步分化為中胚層和定型內(nèi)胚層(definitive endoderm),同時(shí)胚胎前部細(xì)胞分化為外胚層。 基于此,胚胎