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分子生物學(xué)



Nature:發(fā)現(xiàn)與未定潛能克隆造血相關(guān)的新的基因組變異

2022-12-30分子生物學(xué)


在一項(xiàng)新的研究中,來自再生元制藥公司(Regeneron Pharmaceuticals)的研究人員發(fā)現(xiàn)了與未定潛能克隆造血(clonal hematopoiesis of indeterminate potential, CHIP)有關(guān)的新基因組變異。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2022年12月8日的Nature期刊上,論文標(biāo)題為“Common and rare variant associations with clonal haematopoiesis phenotypes”。

在這篇論文中,這些作者描述了他們?nèi)绾问褂萌怙@子和全基因組關(guān)聯(lián)分析來研究一些有體細(xì)胞突變的人的血液中的差異。

造血是一個(gè)導(dǎo)致細(xì)胞血液成分形成的過程??寺≡煅窃撨^程中涉及細(xì)胞系發(fā)育的部分。每個(gè)人一生中的每一天都會(huì)產(chǎn)生大約3000億個(gè)新的血細(xì)胞,這一事實(shí)突出了這整個(gè)過程的重要性。

先前的研究已表明,在某些人身上存在著與CHIP相關(guān)的變異---每種變異都會(huì)產(chǎn)生獨(dú)特的影響。在這項(xiàng)新的研究中,這些作者研究英國(guó)生物庫(kù)和蓋辛格MyCode社區(qū)健康計(jì)劃(Geisinger MyCode Community Health Initiative)等大型數(shù)據(jù)集中的信息,試圖找到其中的一些變異。

為了找到他們所尋找的變異,這些作者將他們的搜索工作集中在已與CHIP相關(guān)的23個(gè)基因上。通過搜索628388人的數(shù)據(jù),他們能夠確定40208攜帶著至少攜帶一個(gè)與CHIP相關(guān)的變異,隨后對(duì)他們所確定的攜帶者進(jìn)行了全外顯子和全基因組研究。在這樣做的過程中,他們能夠確定24個(gè)位點(diǎn),其中21個(gè)位點(diǎn)是以前沒有見過的。他們還發(fā)現(xiàn)他們能夠確定一些可能與某些人的克隆造血和端粒長(zhǎng)度有關(guān)的變異。

每種CHIP亞型的表型組關(guān)聯(lián)圖譜。圖片來自Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05448-9。

在這項(xiàng)新研究的另一部分,這些作者分析了英國(guó)生物庫(kù)中列出的人的健康特征,尋找攜帶CHIP變異的人與其他問題之間的關(guān)聯(lián)。在此過程中,他們發(fā)現(xiàn)攜帶克隆造血變異的人與COVID-19、心臟問題、肥胖和清除各種類型感染問題等疾病之間存在關(guān)聯(lián)。他們還發(fā)現(xiàn)存在有CHIP的人與癌癥腫瘤和骨髓性白血病的產(chǎn)生之間存在關(guān)聯(lián)。( Bioon.com)

參考資料:

Michael D. Kessler et al. Common and rare variant associations with clonal haematopoiesis phenotypes. Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05448-9.

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