分子生物學(xué)
《Nature》連發(fā)兩文:新技術(shù)“FIND-seq”探測(cè)到了以前難以分辨的細(xì)胞們
罕見(jiàn)的細(xì)胞類(lèi)型會(huì)對(duì)人體健康產(chǎn)生不適當(dāng)?shù)挠绊?。先前的研究表明,星形?xì)胞的一個(gè)子集——大腦和脊髓中的星形細(xì)胞——可能是導(dǎo)致多發(fā)性硬化癥(MS)的原因,這是一種免疫系統(tǒng)攻擊保護(hù)神經(jīng)的覆蓋物的疾病。但是找到這些罕見(jiàn)的細(xì)胞并不是一件容易的事情——為了精確定位它們,研究人員需要識(shí)別出獨(dú)特的表面標(biāo)記,從而將這些罪魁禍?zhǔn)准?xì)胞與其他細(xì)胞區(qū)分開(kāi)。單細(xì)胞RNA測(cè)序可以幫助找到它們,即使在沒(méi)有區(qū)分表面標(biāo)記的情況下,但這種技術(shù)可能會(huì)變得非常昂貴。
為了解決這一問(wèn)題,由布里格姆婦女醫(yī)院(Brigham and Women’s Hospital)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)團(tuán)隊(duì),該醫(yī)院是布里格姆醫(yī)療保健系統(tǒng)的創(chuàng)始成員之一,他們開(kāi)發(fā)了一種結(jié)合了核酸細(xì)胞術(shù)、微流體和液滴分類(lèi)的FIND-seq,根據(jù)數(shù)字液滴PCR檢測(cè)到的mRNA生物標(biāo)志物的表達(dá),分離和分析感興趣的罕見(jiàn)細(xì)胞。利用這種方法,研究小組詳細(xì)分析了驅(qū)動(dòng)中樞神經(jīng)系統(tǒng)炎癥和神經(jīng)退行性變的星形膠質(zhì)細(xì)胞群。當(dāng)與其他工具聯(lián)合使用時(shí),F(xiàn)IND-seq確定了由礦物皮質(zhì)激素受體NR3C2和核受體輔抑制因子2控制的信號(hào)通路,這些信號(hào)通路在小鼠和人類(lèi)致病星形膠質(zhì)細(xì)胞的發(fā)育中發(fā)揮重要作用。在另一項(xiàng)研究中,研究人員使用FIND-seq來(lái)確定艾滋病毒在接受抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療的患者的免疫細(xì)胞中“隱藏”的機(jī)制。
BWH神經(jīng)內(nèi)科的通訊作者Francisco Quintana博士說(shuō):“這些發(fā)現(xiàn)為神經(jīng)系統(tǒng)疾病(如MS)的治療干預(yù)確定了新的靶點(diǎn)。”該團(tuán)隊(duì)正在努力開(kāi)發(fā)新的小分子,可以用于治療這種途徑。
FIND-Seq的文章,并在同一期發(fā)表的一篇配套論文中閱讀有關(guān)它在HIV研究中的應(yīng)用。
原文檢索:
1.Identification of astrocyte regulators by nucleic acid cytometry
2.HIV silencing and cell survival signatures in infected T cell reservoirs

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